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Text File  |  1995-03-04  |  2.1 KB  |  48 lines
  1. *********************************
  2. * Alpha-galactosidase signature *
  3. *********************************
  4.  
  5. Alpha-galactosidase (EC 3.2.1.22) (melibiase) [1]  catalyzes the hydrolysis of
  6. melibiose into galactose and glucose. In man, the deficiency of this enzyme is
  7. the cause of Fabry's disease (X-linked sphingolipidosis).  Alpha-galactosidase
  8. is present  in a  variety of organisms.  There  is  a  considerable  degree of
  9. similarity in  the  sequence of  alpha-galactosidase  from  various eukaryotic
  10. species.
  11.  
  12. Escherichia coli alpha-galactosidase  (gene melA),   which  requires  NAD  and
  13. magnesium as cofactors, is not structurally related to the eukaryotic enzymes;
  14. by contrast, an  Escherichia coli  plasmid  encoded  alpha-galactosidase (gene
  15. rafA) [2] contains  a  region  of  about  50 amino acids which is similar to a
  16. domain of the eukaryotic alpha-galactosidases.
  17.  
  18. Alpha-N-acetylgalactosaminidase (EC 3.2.1.49) [3] catalyzes the hydrolysis  of
  19. terminal non-reducing  N-acetyl-D-galactosamine residues in  N-acetyl-alpha-D-
  20. galactosaminides.  In man,  the deficiency  of  this enzyme  is  the cause  of
  21. Schindler and Kanzaki diseases. The sequence  of this enzyme is highly related
  22. to that of the eukaryotic alpha-galactosidases.
  23.  
  24. We selected, as a  signature pattern for these enzymes, the N-terminal part of
  25. the conserved  domain.  The  pattern  contains  two  conserved  aspartic  acid
  26. residues which could be involved in the catalytic mechanism.
  27.  
  28. -Consensus pattern: G-[LIVMFY]-x(2)-[LIVMFY]-x-[LIVM]-D-D-x-W-x(3,4)-R-[DNS]
  29. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  30. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  31.  
  32. -Note: these proteins belong to family 27  in  the  classification of glycosyl
  33.  hydrolases [4].
  34.  
  35. -Expert(s) to contact by email: Henrissat B.
  36.                                 bernie@cermav.grenet.fr
  37.  
  38. -Last update: December 1992 / Pattern and text revised.
  39.  
  40. [ 1] Dey P.M., Pridham J.B.C.
  41.      Adv. Enzymol. 36:91-120(1972).
  42. [ 2] Aslanidis C., Schmid K., Schmitt R.
  43.      J. Bacteriol. 171:6753-6763(1989).
  44. [ 3] Wang A.M., Bishop D.F., Desnick R.J.
  45.      J. Biol. Chem. 265:21859-21866(1990).
  46. [ 4] Henrissat B.
  47.      Biochem. J. 280:309-316(1991).
  48.